Quan els Super 4 arriben a l'Illa del polvorí, es troben que els pirates no els reben a canonades. Quan desembarquen no en troben cap. Resulta que els sykronians han envaït l'illa per proveir-se de lava per alimentar la seva arma destructora. Amb aquesta arma, volen destruir tot el planeta. Però els Super4 els ho intentaran impedir.
Els Super 4 van a la festa de les flors que les fades fan a l'Illa Encantada. Amb gran sorpresa veuen com els deixen entrar sense cap objecció, i això els fa sospitar. Efectivament, algú està robant les fades i les substitueix una per una. Són altre cop els sykronians. Fins i tot capturen la Baba Cara. Al final, però, els Super 4 aconsegueixen derrotar els extraterrestres i recuperar totes les fades i les seves varetes per poder fer la festa de les flors.
L'Àlex i la Ruby són presoners del Baró Negre. Han caigut en un parany i els té retinguts. L'Espurna i en Gene van a rescatar-los, però en Gene no sap lluitar i no es pot enfrontar als soldats del baró. L'Espurna li fa un encanteri perquè tingui més força que ningú i els guanyi a tots. Però al final l'efecte de l'encanteri s'acaba.
A l'Illa Encantada hi ha un torneig en què competeixen la màgia contra ciència. Les fades, naturalment, estan a favor de la màgia, i en Gener i el Doctor X van a favor de la ciència. Però passen coses estranyes que ningú no entén. Fins que es descobreix que al darrere hi ha la Baba Cara, que vol robar el llibre d'or de la màgia de les fades. Ho aconsegueix, i al final només la podran vèncer la màgia i la ciència juntes.
A Medievàlia el Baró Negre s'empesca un pla per fer veure que un drac ataca el regne i convertir-se en el gran heroi. Amb l'ajuda d'en Fourchesac, prepara un combat al pati del castell amb un drac de mentida. Però al final resulta que el drac que apareix és de debò, i els que s'hi han d'enfrontar són els Super4, amb l'Àlex al capdavant.
A l'Illa del Polvorí se celebren els Jocs Olimpirates. El que els guanyi, serà el cap dels pirates. La Ruby hi vol participar i ser la primera noia que els guanya. Al final els únics participants que queden són ella i en Barba de Tauró. Malgrat totes les trampes que els pirates fan perquè guanyi en Barba de Tauró, guanya la Ruby. Però els pirates no la volen com a cap perquè tenen por que els faci rentar-se.
A Medievàlia hi ha una infestació de puces de pirata. En Gene demana un robot al Dr. X per eliminar els paràsits, però el Baró Negre se n'apodera i es torna invencible. Gràcies a això es converteix en el nou rei. En Gene aconsegueix, però, un altre robot, per bé que una mica atrotinat, perquè l'Àlex pugui desafiar a un duel el Baró Negre i recuperar el regne per al seu pare.
La Ruby troba un amulet quan els Super 4 són al món de l'Àlien. Però resulta que està maleït i no paren de tenir desgràcies. Quan decideixen desfer-se'n, en Barba de Tauró els hi roba i no el vol destruir, que és l'única manera de contrarestar el poder malèfic de l'amulet segons la Gran Fada.
El Dr. X i la seva nova ajudant, la Magda, s'endinsen al Bosc Malèfic de la Baba Cara. La Magda cau presonera de la bruixa, que vol que li doni el seu estilet-làser. Els Super 4 hauran de salvar-la, després de passar pel Jardí Graciós i tenir un atac de riure que els dificulta les coses. Han d'evitar com sigui que la Baba Cara sigui més poderosa del que ja és i s'apoderi del l'Illa Encantada.
Els extraterrestres d'en Sykronior instal·len uns aparells a Medievàlia primer i després a altres illes, que n'hipnotitzen els habitants de manera que obeeixen les seves ordres. Els Super 4 han de trobar la manera de destruir aquests aparells perquè en Sykronior no se surti amb la seva i es converteixi en l'amo de tot i de tothom.
La germana de l'Àlex, la Leonora, fa divuit anys i vol fer una festassa. Però l'Àlex està preocupat perquè la Baba Cara, a qui el rei Kenric no es va recordar de convidar a les celebracions del naixement de la Leonora, va jurar que es venjaria el dia que la princesa fes divuit anys. Poc abans de la festa la Leonora desapareix. Tothom la busca pensant-se que ha estat la Baba Cara qui li ha fet alguna cosa.
La reina granota de les fades desapareix amb en Rock Brock per buscar la Fada dels Orígens i demanar-li que compleixi el seu desig de recuperar el seu aspecte normal. Els Super 4 desconfien del mapa que té la reina, i efectivament resulta que és una trampa de la Baba Cara per aconseguir ser ella la reina. Però al final resulta que la Fada dels Orígens existeix i ajuda l'Espurna a desfer-se de la bruixa malèfica.
La Baba Cara escampa una boira violeta per l'Illa Encantada el dia de la cerimònia del gran arbre, que serveix per reforçar la màgia de les fades durant els set anys següents. Aquesta boira fa perdre els poders a les fades, i si no el recuperen abans que es pongui el sol els perdran per sempre. L'únic antídot és baba de cria de drac, que els Super 4 han d'aconseguir per salvar les fades.
Quan els Super 4 investiguen per què han augmentat els atacs de trols al bosc de les fades, descobreixen que és perquè un drac molt gros els ha pres la seva cova i no hi poden tornar. L'Àlex i la Ruby intentaran fer fora aquest drac, que al final resulta que és un dinosaure, perquè els trols tornin a casa seva i se'n vagin del Camaleó, que és on s'han instal·lat mentrestant.
En Rock Brock treu el ceptre màgic del seu lloc i es produeix una ona d'energia que canvia la manera de pensar de tothom. Les fades es pensen que són cavallers, els cavallers es pensen que són científics, els pirates es pensen que són fades, els tecnopolians es pensen que són pirates i en Rock Brock es pensa que es una bruixa. Els Super 4 hauran de tornar al ceptre al seu lloc perquè tot torni a la normalitat.
Quan els Super 4 van a fer un pícnic al bosc, els apareix un laberint d'on surt una veu demanant ajuda. Van a veure què passa i es troben al mig del Laberint de les pors, del qual no podran sortir fins que no s'enfrontin als seus pitjors malsons i els vencin. Al final, l'Espurna, la més poruga de tots, és la més decisiva a l'hora que tots aconsegueixin superar les seves pors i sortir del laberint.
En Rock Brock i en Gene desapareixen mentre fan programa d'holovisió per al Dr. X al Món Perdut. Els seus companys Super 4 els hauran de trobar i rescatar-los, ja que una nova tribu els ha fet presoners. L'Àlien tindrà un paper molt important en tota l'operació de rescat, ja que els de la tribu en qüestió se li assemblen molt.
La Leonora, la princesa de Medievàlia i germana de l'Àlex, vol formar part del grup dels Super 4, i convertir-lo en el Super 5. Per veure si està preparada per ser-ne i si en té ganes de debò, li fan fer una prova, sense que ella ho sàpiga, que consisteix a buscar un tresor inexistent. Sorprenentment, la Leonora ho aconsegueix, amb una mica de sort. Però al final hi ha una cosa que la fa decidir-se a fer-se enrere.